เกิดจากภาวะเอนไซม์บกพร่องหรือการขาดเอนไซม์ย่อยอาหารนั้นๆ หรือภาวะของลำไส้รั่ว (Leaky Gut Syndrome) มีอาการช้ากว่าการเกิดภูมิแพ้อาหารเฉียบพลัน (IgG) โดยอาจใช้เวลาในการเกิดอาการได้มากกว่า 48 ชั่วโมง

อาการอักเสบแบบเรื้อรัง เช่น ท้องอืด ผื่นขึ้น ปวดหัวไมเกรน ปัญหาการลดน้ำหนัก ฯลฯ ไม่รุนแรงถึงขึ้นทำให้เสียชีวิตแต่มักทำให้เกิดความรำคาญที่จะส่งผลกระทบต่อการใช้ชีวิตประจำวัน